Bionic Commando

Dix années se sont écoulées depuis l'affrontement des Impérialistes et de la Fédération lors des événements contés dans le premier jeu Bionic Commando. Après voir battu les Impérialistes fascites et l'Albatross, leur machine de guerre, Nathan « Rad » Spencer fut nommé responsable de la formation d'une nouvelle génération de soldats bioniques. Sous la supervision du directeur du TASC, « Super » Joe Gibson, la bionique devint l'arme la plus sophistiquée des États fédéraux d'Amériques (FSA, Federal States of America), mais la nouvelle technologie ne faisait pas l'unanimité. Certains craignaient qu'il ne s'agisse là de la première étape d'une nouvelle course à l'armement, tandis que d'autres se demandaient ce que deviendraient les humains dans un monde dominé par des bioniques surpuissants.

Des groupes de pression exigèrent la proscription de la technologie ; des manifestations et des émeutes suivivrent. Les choses continuèrent ainsi jusqu'à ce qu'un groupe de soldats bioniques renégats soit accusé d'avoir participé à une rébellion contre les FSA. Une enquête officielle fut ordonnée. L'agent du TASC Spencer, un homme dont la statue décorait l'Avenue des Héros, fut accusé de conspiration, arrêté et privé de son bras bionique, avant d'être rapidement jugé et condamné. Malgré toutes ses protestations d'innocence, Spencer fut condamné à mort pour trahison par un tribunal militaire.

Il n'en fallut pas plus au gouvernement pour agir. La loi qui prit le nom de Purge bionique fut signée ; le développement et la possession de la technologie étaient dès lors considérés comme illégaux. Du jour au lendemain, les soldats du gouvernement furent obligés de rendre leurs implants bioniques au gouvernement... mais pour certains, c'était plus facile à dire qu'à faire. Pour certains en effet, la perte des implants signifiait la perte de la faculté de marcher ou de voir ; pour bon nombre de soldats blessés sur le front, les implants bioniques étaient vitaux.

Se refusant à abandonner leurs implants, des dizaines de bioniques s'enfuirent sous terre, où une organisation favorable à leur cause les accueillit. Une organisation qui voulait s'approprier la technologie bionique, et détestait tout autant les FSA depuis la destruction de l'Albatross. Les Impérialistes avaient été durement frappés par Spencer et les FSA, mais ils n'avaient pas perdu la foi. Le « Programme d'ADN maître » existait toujours, lui aussi. Ce programme avait pour but de faire renaître un dictateur mort depuis de longues années, le « Leader ». Les Impérialistes et les mutinés du TASC commencèrent alors à poser des bombes ici et là et à attaquer de petites cibles gouvernementales, afin d'augmenter leur puissance petit à petit. Ils baptisèrent leur organisation BioReign (Bionic Resurrection Initiative, Initiative de résurrection bionique).

Cinq ans après la Purge bionique et toute une série d'attaques terroristes mineures, BioReign s'empara d'une arme de destruction massive, connue sous le nom de Witherer. Ils la firent exploser à Ascension City, ville phare des FSA. L'arme expérimentale libéra une pulsation kinétique au cœur même de la terre et provoqua un gigantesque tremblement de terre qui réduisit la ville en ruines. Depuis, BioReign occupe la ville et contrôle sa grille de défense aérienne. Le contrôle de BioReign est absolu, ses objectifs restent flous, et après plusieurs assauts terrestres et aériens, les FSA arrivent à cours d'options.

Super Joe se rend compte que Spencer constitue leur dernière chance. Un homme brisé, condamné à mort, attendant son exécution, et à qui l'on a retiré le bras bionique qui avait fait de lui un héros. Mais si on le lui rendait, Spencer deviendrait le seul homme capable de se déplacer dans la ville en ruines. Le seul homme ayant déjà affronté et vaincu les forces du BioReign... le seul homme qui n'ait plus rien à perdre.